Производи

Повреда јетре изазвана лековима је један од главних узрока трошења лекова.Способност предвиђања ефеката на јетру кандидата за лекове на основу њихових хемијских структура је критична за помоћ у вођењу експерименталних пројеката откривања лекова ка сигурнијим лековима.У овој студији, саставили смо скуп података од 951 једињења за које је пријављено да производе широк спектар ефеката на јетру код различитих врста, укључујући људе, глодаре и неглодаре.Ефекти јетре за овај скуп података добијени су као метаподаци тврдњи, генерисани из МЕДЛИНЕ сажетака коришћењем јединствене комбинације лексичких и лингвистичких метода и онтолошких правила.Анализирали смо овај скуп података користећи конвенционалне хеминформатичке приступе и позабавили се неколико питања која се односе на усклађеност ефеката на јетру међу врстама, хемијске детерминанте ефеката на јетру код људи и предвиђање да ли ће дато једињење вероватно изазвати ефекат на јетру код људи.Открили смо да је подударност ефеката на јетру релативно ниска (око 39-44%) између различитих врста, што повећава могућност да специфичност врсте зависи од специфичних карактеристика хемијске структуре.Једињења су груписана према њиховој хемијској сличности, а слична једињења су испитивана на очекивану сличност њихових профила ефеката јетре зависних од врсте.У већини случајева, слични профили су примећени за чланове истог кластера, али су се нека једињења појавила као изузетци.Изрази су били предмет фокусиране регенерације тврдњи из МЕДЛИНЕ-а, као и из других извора података.У неким случајевима су идентификоване додатне биолошке тврдње, које су биле у складу са очекивањима заснованим на хемијским сличностима једињења.Тврдње су даље конвертоване у бинарне напомене основних хемикалија (тј. ефекат јетре наспрам нема ефекта на јетру), а генерисани су модели бинарног квантитативног односа структуре и активности (КСАР) да би се предвидело да ли се очекује да једињење производи ефекте на јетру код људи.Упркос очигледној хетерогености података, модели су показали добру предиктивну моћ процењену екстерним петоструким процедурама унакрсне валидације.Екстерна предиктивна моћ бинарних КСАР модела додатно је потврђена њиховом применом на једињења која су пронађена или проучавана након што је модел развијен.Колико нам је познато, ово је прва студија за предвиђање хемијске токсичности која је применила КСАР моделирање и друге технике хеминформатике на податке посматрања генерисане средствима аутоматизованог рударења текста са ограниченим ручним курирањем, отварајући нове могућности за генерисање и моделирање хемијске токсикологије. података.