Производи

Инфрацрвена спектроскопија је коришћена за мапирање интеракција супстрат-протеин: конформационе промене саркоплазматског ретикулума Ца(2+)-АТПазе након везивања нуклеотида и фосфорилације АТПазе праћене су коришћењем супстратних АТП и АТП аналога (2'-деокси-АТП, '-деокси-АТП и инозин 5'-трифосфат), који су модификовани на специфичним функционалним групама супстрата.Модификације 2'-ОХ, 3'-ОХ и амино групе аденина смањују степен конформационе промене АТПазе изазване везивањем, са посебно јаким ефектима уоченим за последња два.Ово показује структурну осетљивост комплекса нуклеотид-АТПаза на појединачне интеракције између нуклеотида и АТПазе.Све проучаване групе су важне за везивање и интеракције дате групе лиганда са АТПазом зависе од интеракција других лигандних група.Фосфорилација АТПазе је примећена за ИТП и 2'-деокси-АТП, али не и за 3'-деокси-АТП.Не постоји директна веза између обима конформационе промене након везивања нуклеотида и брзине фосфорилације, што показује да пун степен конформационе промене изазване АТП-ом није обавезан за фосфорилацију.Као што је примећено за комплекс нуклеотид-АТПаза, конформација првог фосфорилисаног интермедијера АТПазе Е1ПЦа(2) такође зависи од нуклеотида, што указује да стања АТПазе имају мање униформну конформацију него што се раније очекивало.